Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Fam220aQ3ZN08 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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