Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm28047Q3US59 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm28047Q3US59 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Gm28047Q3US59 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm28047Q3US59 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm28047Q3US59 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Gm28047Q3US59 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm28047Q3US59 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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