Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms