Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Skap2Q3UND0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms