Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Tmem253Q3UNB8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Tmem253Q3UNB8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms