Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trafd1Q3UDK1 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trafd1Q3UDK1 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms