Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

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Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Kdm4dQ3U2K5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Kdm4dQ3U2K5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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