Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rnf149Q3U2C5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Rnf149Q3U2C5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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