Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
LcorlQ3U285 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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