Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q3U1D9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U1D9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U1D9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U1D9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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