Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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