Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdnep1Q3TP92 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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