Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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