Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hddc2Q3SXD3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms