Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Col24a1Q30D77 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Col24a1Q30D77 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm5292-201ENSMUST00000073317 580 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Col24a1Q30D77 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Col24a1Q30D77 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Col24a1Q30D77 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Col24a1Q30D77 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Col24a1Q30D77 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col24a1Q30D77 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms