Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Samd11Q1RNF8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms