Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Traf3ip1Q149C2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms