Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VgfQ0VGU4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VgfQ0VGU4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms