Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rundc1Q0VDN7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc1Q0VDN7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms