Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cnn2Q08093 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms