Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Siah1bQ06985 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms