Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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NfiaQ02780 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NfiaQ02780 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NfiaQ02780 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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