Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
GscQ02591 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
GscQ02591 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
GscQ02591 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
GscQ02591 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GscQ02591 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms