Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EgfrQ01279 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms