Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gja5Q01231 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms