Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
PrcdQ00LT2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms