Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms