Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 4933415A04Rik-201ENSMUST00000056256 2009 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Cited1P97769 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms