Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Arf1P84078 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms