Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SgcdP82347 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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