Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gabpb2P81069 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gabpb2P81069 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms