Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms