Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rps18P62270 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rps18P62270 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms