Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Dpf3P58269 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Dpf3P58269 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Dpf3P58269 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Dpf3P58269 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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