Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
CartptP56388 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CartptP56388 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CartptP56388 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CartptP56388 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms