Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp1P55194 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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