Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Hoxc13P50207 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Hoxc13P50207 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms