Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gli1P47806 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gli1P47806 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms