Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms