Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtbP41155 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtbP41155 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms