Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Timp3P39876 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms