Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col18a1P39061 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms