Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Apoc1P34928 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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