Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nedd1P33215 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms