Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd28P31041 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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