Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm29593-201ENSMUST00000189827 620 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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