Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RxraP28700 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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