Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Ggta1P23336 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ggta1P23336 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms