Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PparaP23204 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PparaP23204 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PparaP23204 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms