Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ntf3P20181 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms